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 Génétique et reproduction

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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 16 Avr 2011 - 15:37

Le problème n'est pas la consanguinité...mais la manière dont elle est utilisée.
Et elle est mal utilisée.
Mais en ce qui me concerne je ne vais pas entrer plus loin sur ce terrain qui fera des dizaines de pages de polémiques si on commence à en parler...Génétique et reproduction - Page 2 0610
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DogElle
 
 


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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 16 Avr 2011 - 15:46

Merci pour tout ses info merci Very Happy
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyVen 18 Mai 2012 - 23:28

Voilà comment on doit calculer un coefficient de consanguinité:

Calcul de la consanguinté
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyVen 18 Mai 2012 - 23:42

Mode Modération On

Mic Comte, merci de passer par la rubrique "Présentation" comme demandé lors de l'inscription au forum.

Mode Modération OFF

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MessageSujet: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 10:16

Bonjour,

Puisque ce sont des termes qui reviennent de temps en temps, je pense que faire un petit topo sur les termes utilisés pour la reproduction ne peut pas être inutile. Pour ceux qui veulent du détails, je vous conseille ce site très intéressant : http://www.vigies-pirates.net/piratologie/selection/
C'est grâce à Artefact (vigie pirates) que je peux vous faire ce poste aussi clair (en tout cas bien plus clair que ce que j'aurais fait avant).
Ce poste n'a pas comme but de créer de débat, uniquement d'informer... Je précise car je trouverai dommage que les informations se trouvent noyées dans des pages et des pages de débats. Ce qui n'empêche évidemment pas d'en parler quand même Wink

Alors pour commencer, quand on fait des portées entre des chiens, puis que l'on reproduit les descendants etc etc, on dit que l'on travaille une famille. Souvent on entend parler de "lignée", une lignée c'est un ensemble d'individus qui ont tous les mêmes ancêtres : ils descendent donc d'un ensemble de couples de base que l'on nomme le groupe fondateur.

La consanguinité désigne le fait qu'un individu possède un ancêtre commun du côté de son père et de sa mère. Si on parle de 2 individus qui possèdent au moins 1 ancêtre commun, on dit qu'ils sont apparentés et s'ils sont reproduits entre eux, ils donneront un individu consanguin.
La consanguinité, ce n'est pas le mal absolu, nous sommes tous consanguins les uns avec les autres à un degré moindre (c'est facile à comprendre, imaginons que je n'ai aucun lien de parenté avec l'homme par exemple, ce qui veut dire que nos parents non plus, nos arrières parents non plus, etc... On imagine bien le nombre d'individus qu'il aurait fallu qu'il y ait sur terre à l'antiquité rien que pour nous deux ^^ Mais on est d'accord qu'on parle de consanguinité à un certain degré Wink ).

Souvent on entend parler de pourcentage de consanguinité, par exemple le mariage père/fille donne des individus qui sont consanguins à 25%. En fait, cela signifie qu'il y a 25% de chance que pour un gène donné cet individu possède 2 fois le même allèle.

Rappel:
 

Donc à la base du travail de la famille/lignée, on a un couple de reproducteur : c'est la F0 ou G0, c'est-à-dire la génération 0. Les individus qui naissent du premier couple forment donc la F1 ou G1. Puis on les reproduit et ils donnent la F2, etc etc. Donc quand on parle de F5, on parle de la génération née du 5ème mariage depuis le couple de base.

Ensuite, en reproduction on utilise pleiiiin de termes anglais ^^ Vous en avez déjà sûrement entendu parler : linebreeding, inbreeding, outbreeding. Ils désignent uniquement le degré de consanguinité avec lequel on travail.

Outbreeding : on élève donc uniquement avec des individus qui n'ont aucun ancêtre commun (en tout cas, aucun connu, cf ci-dessus). On parle d'outcrossing pour chaque croisement fait entre des individus dont on considère qu'ils n'ont aucune apparenté. C'est souvent ce qui est fait quand on a peur de ce que peut donner la consanguinité sur nos individus : mise en exergue de maladies principalement (le cas le plus simple c'est quand un chien est porteur d'un gène récessif pour une maladie, si on le croise avec un individu qui a un certain pourcentage de chance de porter les mêmes allèles, les petits auront alors un pourcentage de chance de posséder 2 fois cet allèle donc d'être malade... Evidemment ce n'est pas forcément si simple pour les maladies...)

Inbreeding : c'est le total opposé de l'outbreeding, là on ne fait QUE des portées hautement consanguines (frère-soeur, père-fille, etc). C'est ce qui est utilisé dans les laboratoires par exemple : ça permet de connaître exactement le génotype (ensemble des gènes) des individus qui naîtront et donc de contrôler un maximum ce qui normalement n'est pas contrôlable

Linebreeding : on élève donc en faisant des reproductions avec des individus issus de la même lignée, c'est-à-dire en fait qu'on ne fait que des portées consanguines. La différence avec l'inbreeding c'est qu'ici on interdit les croisements trop proches, afin de maintenir une certaine diversité génétique tout en contrôlant les caractères des individus.

Bon, ça me paraît déjà pas trop mal comme résumé, s'il y a d'autres termes à traiter, n'hésitez pas ^^ (je vous parlerai de dépression toussa plus tard)


Dernière édition par Vazaha le Sam 14 Juin 2014 - 12:53, édité 1 fois
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 11:04

Ah super! Génétique et reproduction - Page 2 2176152401


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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 13:57

Ensuite, on nous parle souvent de la perte de la diversité génétique et de ses risques... C'est souvent ce qu'on appelle la "dépression consanguine" ou "dépression endogamique". Rien que le terme fait peur, mais en fait, ça veut dire quoi ?

Pour comprendre tout ça, il faut en fait comprendre qu'on s'intéresse à l'évolution des populations, et à leur capacité à survivre au fil des générations. Je vais donc faire un petit laïus sur tout ça et des termes que l'on retrouve assez fréquemment quand on parle évolution, reproduction...
Donc à la base, les espèces ont différentes stratégies de reproduction :
-la stratégie dite "r" : les individus sont très nombreux, se reproduisent énormément et rapidement : on table sur la fécondité et non la survie des individus. L'exemple type c'est le rat.
-la stratégie dite "K" : c'est l'inverse, les individus vivent longtemps, vont faire très attention à leur progéniture qui est peu nombreuse. On voit d'ailleurs souvent des comportements qui vont avec : des individus qui grandissent lentement, des parents qui s'en occupent longtemps... On table sur la survie et non sur la fécondité. Un exemple qui pourrait vous parler c'est l'éléphant.
Il existe évidemment tous les intermédiaires.

Parmi les individus qui se reproduiront, quelle que soit la stratégie reproductive de l'espèce, certains individus vont plus se reproduire que d'autres : ils ont une valeur sélective ou fitness forte. Pourquoi parler de "valeur sélective" ? En fait tout simplement parce que quand cet individu se reproduit, il transmet 50% de ses gènes, donc s'il y a un caractère qui permet à certains individus de se reproduire plus que d'autres, on va retrouver beaucoup de descendants portant ce caractère. Il y a donc une sélection de ce caractère.

Exemple : les souris à abajoues. Ces souris ont un pelage soit noir soit agouti/marron, elles sont chassées principalement par un hibou (le grand hibou à cornes) qui distingue les couleurs la nuit. Sur des milieux sombres (anciennes coulées de lave), il va donc voir plus facilement les souris agouti : les souris noires survivent plus et se reproduisent. Au contraire sur les sols sableux et clairs ce sont les souris noires qui sont chassées et les agoutis qui se reproduisent.

Pour en revenir à ma dépression consanguine ou dépression endogamique, c'est simplement la baisse de la valeur sélective des individus.
C'est simple à comprendre : quand il y a beaucoup de consanguinité, on arrive à beaucoup d'individus qui portent 2 fois le même allèle (ils sont homozygotes). Le soucis c'est que pour certains allèles délétères, cela va provoquer des soucis que l'on imagine (et voit malheureusement chez certaines races).

Mais pourquoi faire de la consanguinité malgré tout ?
Pour plusieurs raisons, qu'elles vous semblent valables ou non, je vous expose ici celles qui sont en ma connaissance, j'imagine qu'il y en a d'autre. Encore une fois, je n'ai pas pour but de créer de polémique, uniquement d'exposer les faits ce qui ne veut pas dire que je suis d'accord avec telle ou telle façon de faire, j'essaie d'être la plus neutre possible.

-les besoins des scientifiques et chercheurs. Pour tout ce qui est test sur les animaux, il faut contrôler au maximum des choses qui ne sont pas vraiment en notre contrôle : le vivant. Alors on fait de l'inbreeding. Certaines lignées se retrouvent ainsi avec d'énormes soucis/ne sont pas viables et sont sacrifiés pour les besoins de la science. Et pour celles qui ne sont pas non viables on connaît tout. Pour montrer jusqu'où ça va dans un domaine que je connais, chez certaines lignées de rat on a systématiquement 6 petits qui naissent à chaque portée : 3 mâles et 3 femelles. On connaît tous les risques de tumeurs de façon exacte, ce qui permet de faire des études comparatives.

-faire apparaître des critères morphologiques précis, c'est le cas dans le monde du chien par exemple. C'est ce qui a aboutit à l'hypertype, ça permet de très très facilement et très rapidement faire apparaître des caractères phénotypiques (que l'on "voit").

-fixer des caractères "santé", si la consanguinité forte a de gros risques de faire apparaître des individus non viables, on va aussi pouvoir sélectionner les individus qui ne sont pas atteints par ces soucis.

Beaucoup de chercheurs se sont penchés sur tout ceci, car travailler en outbreeding fait qu'à chaque fois on "dilue", mais on ne peut rien fixer donc selon l'orientation de l'élevage (scientifique ou non scientifique, peu importe), cela ne sera pas forcément recherché. Mais vu les soucis auxquels peuvent mener "trop de consanguinité", ils ont beaucoup cherché des intermédiaires.
Ils ont donc cherché des méthodes qui, à partir d'un groupe fondateur, cherchent à faire des générations qui auront un taux de consanguinité minimal, inférieur à celui qu'il y aurait dans le cas de reproductions aléatoires à partir de ce groupe fondateur (donc s'il n'y a que 2 couples fondateurs, on monte rapidement dans les pourcentages, si on part avec 20 groupes fondateurs, ça monte beaucoup moins vite évidemment Wink ).

C'est là que va entrer en jeu ce que l'on nomme une "retrempe"... On fait de la consanguinité et puis pof, on s'aperçoit qu'il y a de gros soucis (par rapport à ce que l'on souhaite évidemment ! La plupart du temps ce sera niveau santé, mais ça peut être aussi morphologique). Bref, comme on travaille en circuit fermé, on sait qu'on ne pourra pas (ou difficilement... mais on ne va pas entrer dans le détail) changer ça, donc on va chercher un individu externe qui n'a pas du tout de lien, ou alors que très très peu ! (de toutes façons, rappelons nous, nous sommes tous consanguins à un degré très faible, donc en fait au bout d'un nombre de générations -je ne saurais plus vous dire pour ça-, on estime qu'on est à 0% de consanguinité). On introduit cet individu, on le marie avec notre lignée. C'est ce que l'on nomme la retrempe : les individus qui naissent de ce mariage sont à 0% de consanguinité. Par contre, on repart ensuite en circuit fermé, donc les individus suivant auront aussitôt des taux de consanguinité qui augmentent, plus rapidement qu'en outbreeding.

Je pense que là j'ai fait pas mal le tour, j'ai tendance à partir trop loin XD Un autre site très bien fait sur la génétique et la consanguinité dans le monde du chien : Site du Braque du Bourbonnais - section génétique


Dernière édition par Vazaha le Sam 14 Juin 2014 - 14:25, édité 1 fois
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 14:02

PowerUser a écrit:
Ah super! Génétique et reproduction - Page 2 2176152401


^^ Hésite pas si y'a des trucs mal dits/qui manquent/en trop Wink
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MuzaRegne
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 16:13

Au sein d'une population, même lorsqu'elle semble homogène, il existe toujours de nombreux caractères pour lesquels des variations entre individus sont constatées, qu'elles soient visibles au niveau phénotypique (morphologie, physiologie, comportement, etc) ou non.
Les variations du phénotype sont dues pour partie à des facteurs environnementaux (alimentation, climat, etc) et pour partie à des différences entre les génotypes individuels, transmissibles à la descendance.

La variabilité génétique (ou diversité génétique) est l'ensemble des différences de génotype entre des individus d'une population.

Variabilité génétique ==> pour un locus donné, plusieurs allèles existent
                                    pour un locus donné, plusieurs allèles sont présents chez plus de 1 % de la population


La variabilité génétique est importante pour la survie d'une population :

- elle permet l'adaptation de l'espèce à son milieu grâce à la sélection naturelle. Lors d'un changement du milieu (par exemple, évolution climatique = refroidissement) certains allèles vont permettre à certains individus mieux adaptés de survivre (davantage de graisse sous cutanée).
- elle permet l'hétérozygotie → hétérosis ou vigueur hybride.
Hétérosis = augmentation de la viabilité et des performances chez les individus à forte hétérozygotie. Meilleures longévité, immunité, fertilité, prolificité …
- pour une espèce domestique, elle permet la sélection artificielle = l 'élevage de sélection = le choix entre plusieurs caractères. Si toute la population est identique … pas de choix possible !


================================


Pour revenir sur la dépression de consanguinité : c'est donc le contraire de l'hétérosis. Augmentation de l'homozygotie due à la consanguinité = diminution de la longévité, de la fertilité, de la prolificité, de la rusticité car l'efficacité du système immunitaire est meilleure chez les individus hétérozygotes.
Les "avantages" de la consanguinité ne sont des "avantages" que pour l'éleveur : ni l'individu ni la population n'y ont d'intérêt.
Le deuxième gros inconvénient de la consanguinité, en plus de la dépression consanguine (à l'échelle de l'individu), est la perte de variabilité génétique (à l'échelle de la population) due à consanguinité + sélection, pas à la consanguinité seule - mais quand on parle de consanguinité appliquée volontairement sur des animaux d'élevage, évidemment qu'elle est assortie à une sélection.
Autre chose encore : la fixation des caractères : on fixe ce que l'on recherche, mais le reste aussi. On ne peut pas choisir que les bons allèles ! Et justifier par "la consanguinité ça doit se faire sur des chiens sains", c'est se voiler la face, un individu génétiquement sain, ça n'existe pas (ou si peu !). Chez le chien on considère qu'en moyenne chaque individu porte 5 gènes délétères (c'est peu d'ailleurs, il me semble que chez l'homme c'est plus, si quelqu'un retrouve une source). D'où l'apparition de "nouvelles maladies" au gré des modes et des étalons populaires - voir ce texte : Le syndrome de l'étalon populaire de CA Sharp. Il y a aussi "The poodle and the chocolate cake" du Dr John Armstrong mais je ne sais pas s'il a été traduit.

Plus généralement, tout lire sur le site The canine diversity project.

Je vais essayer de retrouver le texte d'une conférence donnée par un généticien lors d'une expo mondiale, en Hollande je crois ... me souviens plus des détails, je vais fouiller et je reviens si je trouve.


Dernière édition par MuzaRegne le Sam 14 Juin 2014 - 18:38, édité 2 fois
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 16:41

J'y connais que dalle mais c'est intéressant tout ça, merci Vazaha et Muza'.
Mon doudou est donc un "linebreeding" avec toutes les conséquences de fragilité que cela implique  Sad 
et son père est un "étalon populaire", papa de je ne sais combien de centaines de chiots en France  Crying or Very sad
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 18:32

Hop voilà :
Genetic management of dog breed populations par Ed. J. Gubbels
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 18:50

Super intéressant, beau boulot les filles!
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 20:49

Merci MuzaRegne pour les compléments Smile
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 21:44

Si ça intéresse quelqu'un, j'ai ça:

http://books.google.fr/books/about/The_Genetics_of_the_Dog.html?id=bgZwjdB4xgEC&redir_esc=y

Ca ne fait que 572 pages! Very Happy

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MessageSujet: nez plat écrasé brachycéphale   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 21:45

Uhu ! XD Euuuuh... Je passe ? XD
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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptySam 14 Juin 2014 - 21:50

Je suis déçuTe!  Génétique et reproduction - Page 2 2619555490 

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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyLun 15 Fév 2016 - 22:12


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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyLun 28 Aoû 2017 - 12:55

http://www.20minutes.fr/insolite/diaporama-12713-journee-mondiale-chien-moche
si la plus part sont juste de "vieux chiens" avec une certaine race...
le pauvre bulldog !!!!

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u Pensez à utiliser la fonction "Chercher" en mode simple ou avancé . u
4 lettres mini et une étoile * si vous ne cherchez qu'une partie du mot.
Si le mot recherché ne fait que 3 lettres ou moins, passez par la fonction "Recherche Avancée" cliquez sur le bouton google.

Bonnes vacances à tous et toutes  !
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MessageSujet: syndrome brachycéphale   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyLun 28 Aoû 2017 - 16:10

Mitee, je remets ici ce que tu avais publié ailleurs! Very Happy

Parce qu'au niveau du brachycéphale, on est quand même allé très loin!!!! Sad

mitee a écrit:
http://www.boulesdefourrure.fr/index.php?post/2016/06/27/Jour-six-motif-eternuements

Citation :
Le syndrome brachycéphale…

Comment vous expliquer cette magnifique cascade de troubles ? Imaginez un ensemble de symptômes liés à l'anomalie de conformation de tous les chiens (et chats) à face plate. L'idée est simple : on leur a enfoncé le museau dans le crâne. On l'a martelé pour l'aplatir et l'épater, du coup : les yeux sont trop saillants, sujets à des conjonctivites, distichiasis, entropions, ulcères, voire à la luxation du globe.

Les narines sont trop fermées, ce qui gêne l'entrée de l'air à l'inspiration, du coup l'animal force, force pour inspirer. Essayez chez vous : bouchez-vous le nez aux trois quarts et forcez pour inspirer. Vous sentez votre estomac remonter vers votre cœur, et, peut-être une envie de vomir poindre le bout de son nez (plat) ?

Faites ça à chaque respiration, vivez avec le thorax à l'horizontale comme tout quadrupède qui se respecte, et je vous promets une belle hernie hiatale (l'estomac qui s'enfonce dans le thorax à travers le diaphragme) associée à des reflux gastro-oesophagiens, car le cardia, le sphincter qui ferme l'estomac, le fermera beaucoup moins bien. Les acides vont remonter vers la gorge et venir irriter les cartilages qui constituent la porte d'entrée de la trachée, le voile du palais (qui est trop en arrière et trop long chez les brachycéphales et a tendance à pendre dans la trachée…), les amygdales, bref, toute la gorge, le carrefour entre les voies digestives et respiratoires. Vous êtes-vous déjà étouffé en avalant de travers, en ayant l'impression que vous alliez y passer ? C'est le quotidien de ces chiens qui sont, du coup, à risque de pneumonie par inhalation/fausse déglutition.

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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyJeu 19 Juil 2018 - 22:21

https://www.svk-asmpa.ch/images/position/position-SVK-ASMPA-chiens-a-face-plate-court.pdf

Posez-vous  ces  questions  avant  l’acquisition d’un chien brachycéphale:
1.
Doit-il vraiment être un chien avec un nez plat ou plutôt un chien de petite taille mais avec un nez plus long ? Plus de carlins et bouledogues seront achetés, plus ils seront «produits» dans des conditions déplorables. Cela suit la loi du marché.
2.
De quel élevage provient le chien ? Est-ce un élevage reconnu ? Est-ce qu’après l’achat du chiot, l’éleveur sera encore joignable ? Malheureusement, un grand nombre de chiots sont vendus sur des aires d’autoroutes près des frontières et passe d’un coffre de voiture à l’autre.  Sur internet, les petites annonces de vente de chiots proviennent essentiellement des pays de l’Est.
3.
Ai-je eu l’occasion de pouvoir voir les parents et respirent-il normalement ? La brachycéphalie est héréditaire ; ainsi l’état respiratoire du père comme de la mère est décisif sur la future capacité respiratoire des descendants. Les «ronflements» ne doivent pas être considérés comme un bruit normal.

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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyMer 1 Aoû 2018 - 20:24

Clairement, je préfère le premier! On pourrait faire un montage similaire avec un Boston Terrier!

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MessageSujet: Re: Génétique et reproduction   Génétique et reproduction - Page 2 EmptyVen 1 Mar 2019 - 21:26

mitee a écrit:

lien FB sur les brachicéphales de toutes espèces



Spoiler:
 

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et parce qu'on parle de la disparition "programmée" du nez dans ce post là aussi : http://educationcanine.forumactif.com/t2159p50-chien-finnois-de-laponie-ou-lapinkoira?highlight=lapin%2A

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