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     Comment calculer le taux de consanguinité?

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    MessageSujet: Comment calculer le taux de consanguinité?   Ven 15 Avr 2011 - 16:37

    coucou, je me pose la question comment caluler le taux de consanguinité d'un chien ?? (sa fait une 1h que je cherche mais rien de très clairs) et jusque a conbien de génération on peut le calucler??
    merci d'avence
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 0:41

    dsl ca je ne maitrise pas du tout ! peut etre derby ?

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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 7:03

    Je crois que j'ai qque chose la dessus, il faut que je cherche
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 8:44

    Si ton chien a "des papiers", c'est écrit ... s'il n'a pas encore ses papiers, tu peux voir le taux de consanguinité des parents sur leur pédigrées.
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 10:30

    Il y a une formule pour le calculer, je dois pouvoir la retrouver dans mes cours de génétique, mais c'est assez complexe! Et il faut avoir tout l'arbre généalogique, le plus loin possible.
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 10:38

    élyte a écrit:
    sa fait une 1h que je cherche mais rien de très clairs

    Tu as cherché sur Google ?
    Parceque ça donne pas mal de résultats...surtout pour les chats, ce qui n'a aucune importance.
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 12:35

    Déjà merci pour vos réponse.Pour Mitee t'en fait pas sais pas grave.

    Lilliefox a écrit:
    Si ton chien a "des papiers", c'est écrit ... s'il n'a pas encore ses papiers, tu peux voir le taux de consanguinité des parents sur leur pédigrées.

    oui elle est LOF mais sur sont certificat de naissance il n'y avais rien et la j'attend les définitife (mais la scc prendent sont temp mais je pence les recevoir la semens prochaine)

    Elwing a écrit:
    Il y a une formule pour le calculer, je dois pouvoir la retrouver dans mes cours de génétique, mais c'est assez complexe! Et il faut avoir tout l'arbre généalogique, le plus loin possible.


    j'ai trouvé sa: 1/2x(1/2)n1x(1/2)n2 (mais je patoge avec la profondeur des génération)et pour l'arbre je suis entrin de le faire justement je réusie a retrouver un chien née en 1906 mais sa prend du temp je doit en etre vers 230 chiens pour le moment.

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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 13:02

    Après vérification, ce n'est pas sur les papiers officiels de la SCC que j'ai vu inscrits les taux de consanguinité pour ma chienne et ses ascendants mais sur le site "chiens de france" où le pédigrée avait été déposé.
    Ne peux-tu pas en savoir plus par ton éleveur ? ou par le club de race ?
    J'ai l'impression que tu remontes vraiment beaucoup trop loin (1906)
    Et pourquoi veux-tu le calculer ? (curiosité)
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 13:14

    Lilliefox a écrit:
    Après vérification, ce n'est pas sur les papiers officiels de la SCC que j'ai vu inscrits les taux de consanguinité pour ma chienne et ses ascendants mais sur le site "chiens de france" Et pourquoi veux-tu le calculer ? (curiosité)


    oui sais se qui me senblais que se n'est pas sur les papiers et je voudrais le calculer pour voirs si il est elever ou non et tout sinplement par curiosité,conaire la ligner de ma chienne, ses ancêtre
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 14:36

    Voilà les infos que j'ai conservées :
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 14:37

    Consanguinité
    Facteurs génétiques influençant la dynamique d’une population

    http://www.conservation-nature.fr/article1.php?id=303

    La dépression de consanguinité, la diminution de la valeur sélective d'individus issus de croisements consanguins par rapport à des individus issus de croisements non-consanguins, est un phénomène très largement répandu.
    Consanguinité

    La consanguinité est le fait que deux individus, ayant une parenté assez étroite se reproduisent entre eux et obtiennent une descendance.

    La consanguinité entre deux individus (personnes ou animaux) se définit comme la proportion d'allèles identiques par descendance. La consanguinité est responsable d’une augmentation de l’homozygotie, et d’une diminution de la valeur sélective des descendants (c’est la dépression de consanguinité).

    La consanguinité est la probabilité que deux allèles pour un même gène soient homozygotes, car provenant d'un ancêtre commun. Le taux de consanguinité est un nombre compris entre 0 et 1, souvent exprimé en pourcentage. Il permet de constater la proximité génétique entre deux individus. Puisque chaque allèle provient d'un parent, on mesure ainsi la probabilité que les allèles viennent du même ancêtre.
    Dépression de consanguinité

    La dépression de consanguinité correspond à une réduction de la valeur sélective de la descendance issue de croisement autogame consanguin par rapport à la valeur sélective de la descendance issue d’un croisement allogame.

    L’augmentation du taux de consanguinité provoque une augmentation de la dépression de consanguinité. La dépression de consanguinité ne s’exprime que si il existe des croisements consanguins (et donc seulement dans les descendances de ces croisements) ou si on a une réduction brutale de la taille des populations qui va augmenter la consanguinité par dérive génétique.

    La dépression de consanguinité augmente la fréquence des tares, diminue la survie et la fécondité (fitness) et diminue la productivité.
    Dérive génétique


    La dérive génétique est un processus par lequel les fréquences alléliques changent dans les petites populations à cause de biais aléatoires d’échantillonnage dans la transmission des allèles d'une génération à l'autre.

    Elle correspond à la modification de la fréquence d'un allèle, ou d'un génotype, au sein d'une population, indépendamment des mutations, de la sélection naturelle et des migrations. La dérive génétique est causée par des phénomènes aléatoires et imprévisibles, comme, par exemple, le hasard des rencontres lors de la formation des couples dans le cas d'une reproduction sexuée. Les effets de la dérive génétique sont d'autant plus importants que la population est petite, car les écarts observés par rapport aux fréquences alléliques y seront d'autant plus perceptibles. Du point de vue d'un gène, la dérive génétique conduit à l'augmentation ou la diminution de la fréquence dans la population, de l'un de ses allèles.

    Dans le cadre d'une reproduction sexuée, un individu qui ne se reproduit qu'une seule fois, ne va transmettre à son descendant que la moitié de ses allèles. C'est au cours du brassage génétique aléatoire, lors de la méiose que vont être transmis certains allèles et pas d'autres. Pour qu'un individu puisse transmettre à coup sûr la totalité de ses allèles, il faudrait que le nombre de descendants tendent vers l'infini. En conséquence, dans toute population, il est statistiquement inévitable que certains allèles ne soient transmis par aucun adulte à leur descendance. De plus, certains individus n'ont pas de descendance du tout. Le nombre des allèles (la variabilité génétique) se réduit donc. Parmi les allèles « survivants », certains vont voir leur fréquence originelle diminuer ou au contraire augmenter.

    La dérive génétique et la perte de diversité génétique sont des phénomènes naturels, mais ils peuvent être amplifiés par des pratiques artificielles, aboutissant à la réduction des effectifs (exemple de la chasse) ou suite à une fragmentation du paysage (déforestation, utilisation agricole) ou encore par la dépression de consanguinité, notamment par effet Allee.

    L'arrivée d'un nouveau parasite peut être "supportée" par une population si elle est assez vaste, car il y aura une sélection naturelle des génotypes résistants. Si la population est trop petite, la probabilité qu'il existe un allèle adapté au nouveau facteur de l'environnement est faible. Le risque d'extinction de l'espèce sera donc plus important. Par conséquent, pour limiter ce risque d’extinction, il est nécessaire de maintenir les espèces à l'état sauvage avec des effectifs significatifs, afin d'empêcher les effets délétères de la dérive génétique.
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 14:37

    Génétique et consanguinité

    http://cc.ysu.edu/~helorime/inbredgen.html


    quelques arguments solides en défaveur de la consanguinité, provenant de la génétique.
    Le moyen utilisé : l'échiquier de croisement. Pour ceux qui ne connaissent pas il s'agit d'un calcul de probabilité pour un être vivant (quel qu'il soit) de recevoir tel gène de son père ou sa mère, donc soit d'être indemne, soit porteur sain, soit malade (pour l'exemple d'une maladie génétique).
    La plupart des maladies génétiques sont rarissimes en expression, mais présentes chez tous les individus et apparaissent par mutation dans le génome chez un individu, de façon aléatoire. Cet individu s'il est porteur sain et reproduit transmettra la maladie à la moitié de sa descendance. Ces descendants seront porteurs sains et sans mariage consanguin la probabilité qu'ils rencontrent un autre porteur sain est quasi nulle. Mais avec un mariage consanguin seul un quart des descendants seront indemnes, la moitié seront porteurs sains et le dernier quart seront malades... Aucun génome et je dis bien aucun n'est totalement indemne de problèmes survenus par mutation. Ce qui fait que lors des accouplements consanguins la fertilité est diminuée, car nombre d'embryons sont porteurs d'anomalies métaboliques létales et ne parviennent pas à terme.

    Autre argument génétique contre la consanguinité : l'immunité, dont l'un des facteurs génétiques primordiaux est le système HLA. Ce système HLA code pour la production d'anticorps fabriqués par les lymphocytes, globules blancs nous soignant dans les longues et graves maladies. Chaque version de ce système HLA permet la production d'une gamme d'anticorps déterminée, et chaque lignée d'êtres vivants possède "sa" version de système HLA. De fait à chaque mariage non consanguin les descendants héritent toujours de 2 versions différentes de HLA, ce qui accroît considérablement la gamme d'anticorps fabriqués et donc la résistance aux maladies. Or en cas de consanguinité proche ce bénéfice se perd, les descendants sont homozygotes c'est-à-dire qu'ils ont en double exemplaire une seule et même version de système HLA. Ces individus sont généralement immunodéficients.

    Plus concrètement chez le skye la consanguinité s'est révélée une catastrophe pour la race. Les 2 guerres mondiales ont réduit à chaque fois le cheptel à moins de 10 individus. Les skyes d'aujourd'hui en ont subi les conséquences, car les éleveurs pratiquant en plus de la consanguinité derrière ces événements ont fini par faire ressortir des problèmes génétiques jusque là ignorés : insuffisance rénale juvénile, shunt du foie, baisse immunitaire, prédisposition aux allergies comme la dermatite atopique, cancer de la mamelle et troubles du comportement graves (ce qui a donné une réputation de chien méchant au skye). Heureusement certains éleveurs ont décidé d'en finir avec ces méthodes, et leurs lignées sont saines (même s'il reste des troubles résiduels comme les allergies). Mais la consanguinité continue... Et est en train de mener la race à l'extinction. Les effectifs ont été divisés par 10 en 10 ans et les éleveurs honnêtes s'accordent à dire que si l'on continue ainsi dans 40 ans il n'y aura plus de skye car le pool génétique est déjà à la limite de la viabilité.

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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 14:39

    Consanguinité planete gene

    http://www.planetegene.com/article/lhomme/les-maladies-genetiques/consanguinite-et-genetique

    Oui, la consanguinité pourrait ne pas être dangereuse... Théoriquement ! Déjà nous ne pouvons pas connaître le génome entier d'un individu chien ou humain, ce qui empêche d'être sûr à 100% qu'il soit indemne de tares récessives, et en pratique dans la nature et même dans les lignées les plus consanguines d'animaux de laboratoire les individus indemnes de tares récessives n'existent pas. C'est le souci de certains éleveurs qui veulent absolument faire de la consanguinité, ils prétendent que leurs reproducteurs sont indemnes de tares. Ça me fait doucement rigoler, car c'est impossible pour un individu d'être indemne de tares génétiques cachées et cela prouve bien qu'ils ne connaissent absolument rien à leur sujet. Pourquoi curieusement remarquent-ils une baisse de fertilité chez leurs chiennes consanguines ? Pourtant elles produisent autant d'ovocytes que les autres, pas de souci là-dessus. Le souci est que les tares récessives dont sont porteurs ces ovocytes sont tellement graves qu'unis à un spermatozoïde d'un parent, l'embryon sera si gravement malformé qu'il avortera de lui-même dès les premiers jours de développement. Peu de chiots arriveront à terme, et l'éleveur n'aura rien su que sa chienne attendait 8 chiots alors qu'elle n'en a accouché que de 2. Tout a l'air normal, mais ça ne l'est pourtant pas !
    Ce qui est anormal aussi, c'est de vouloir faire de la consanguinité, donc augmenter l'homozygotie, alors que de nombreux gènes indispensables au bon fonctionnement du corps ne peuvent fonctionner qu'à l'état hétérozygote et quelle que soit leur version si ces gènes sont homozygotes ils conduiront à la mort ou à une grave maladie. C'est le cas du complexe HLA chez tous les êtres vivants qui détermine l'immunité. C'est aussi en Afrique le cas du gène de la drépanocytose qui s'il est létal à l'état homozygote protège du paludisme à l'état hétérozygote, et expose à la mort par paludisme ceux qui n'en sont pas porteurs. On ne peut donc demander à la nature une homozygotie forcée et dangereuse pour l'organisme. Ce qui se passe pour les chiens s'appelle la dépression de consanguinité, et c'est ce qui aujourd'hui condamne aussi l'espèce du guépard à mort. Aujourd'hui tous les guépards sont infertiles et ont tous le même typage HLA ce qui les rend très vulnérables aux maladies. C'est un cas grave et typique de dépression de consanguinité. (Aujourd'hui le skye terrier est d'ailleurs dans le même cas que le guépard) Aujourd'hui seul un apport génétique de guépards morts depuis longtemps et naturalisés pourrait sauver le guépard, à moins d'opter directement pour la transgénèse pour élargir le patrimoine génétique au niveau des types HLA... A quoi la consanguinité est-elle donc bonne si à la fin l'être vivant se retrouve si malade qu'on
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 15:37

    Le problème n'est pas la consanguinité...mais la manière dont elle est utilisée.
    Et elle est mal utilisée.
    Mais en ce qui me concerne je ne vais pas entrer plus loin sur ce terrain qui fera des dizaines de pages de polémiques si on commence à en parler...
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    MessageSujet: Re: Comment calculer le taux de consanguinité?   Sam 16 Avr 2011 - 15:46

    Merci pour tout ses info merci Very Happy
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    Comment calculer le taux de consanguinité?

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